甘肃少数民族围绕自己的教义，也有各种禁忌。
藏族禁忌杀生，无论是天上飞的，如鹰鹫、大雁及小鸟等；还是地上跑的，如，虎、豹、狼、马、驴、骡、蛇、昆虫等；甚至是水中游的，如鱼、蛙、虾等，一律不能杀害。即使牛羊肉是他们平日的口中之餐，但在宰杀它们时，一定要念专门的经文，由专人去宰杀，不然会遭致神灵的报复。禁止出卖被指命的“神畜”；禁止在神山处动土、狩猎、伐树、挖药；禁止在河流、水泉、井旁抛扔不洁之物，更不准在这些地方进行大小便。在任何一种宗教仪式上，特别是在释迦牟尼诞辰、成佛、圆寂的纪念中，忌说不洁之语或杀、宰、死之类的凶词。即使在宗喀巴的任何纪念日中也同样忌讳说任何不吉、不洁、不祥的话语。在去寺院的路上，一般不许挤别人而抢路先行，沿途休息时，要盘腿端坐，不能随意躺卧或有失态之姿。不管多困，也要保持衣着整齐，更不能敞露胸怀。
裕固族忌六月、腊月动土，逢虎、狗、鼠、蛇日，不搬帐篷；忌穿红衣、骑红马之人走进帐篷；禁食尖嘴圆蹄动物肉；每逢初一、十五拜佛日，不出卖牲畜；俗人不准骑马经过寺院，在寺院跟前严禁大声喊叫；到寺拜佛过经堂，男人由左进，女人由右进，男人必须脱鞋进左脚，并用袖口捂嘴，用左手点长明灯；妇女不能到佛像跟前去，产妇不准进寺院。
东乡族、保安族的禁忌行为极多。《甘青特有民族文化形态研究》中有详载：每次做礼拜前要进行沐浴，诸凡逢年过节、婚丧嫁娶，远方归来，宰牲之前，甚至是炸油香之前，首先要做的就是小净或大净。他们认为，只要用清净的水按照一定的程式可以洗涤身体的污垢，甚至心灵的污垢，达到身心的清净。他们每天都在坚持着这种洗浴，每天用特制的“汤瓶”（穆斯林家中必备的用于净手洁体的盛水用具，有弯把，前面是弯形的壶嘴）或“吊罐”（也是穆斯林家中用于做大净的盛水器，下面有小口，吊起来拧开小口可以盥洗全身）洗浴。洗大、小净时，他们不用脸盆，认为反复用过的水不洁净，只有用流动的水冲洗才最干净。他们忌讳在盛水器中洗东西，认为那样很不卫生。他们的井上都用木头盖子盖住，打水的桶用绳子吊在井里空中，再在井口用盖子盖上，甚至连他们吃饭的碗都是整整齐齐，千干净净地扣在柜子里。
在饮食禁忌方面，东乡族和保安族人同所有的穆斯林是大体相同的。他们严格地遵守着伊斯兰教规，禁食猪肉、驴肉、狗肉或是自死动物的肉及一切动物的血。而且，所有的穆斯林不允许任何人有意识地在他们面前出示猪肉，更不允许把猪肉或其制品带进他们的饭馆。否则，被他们视为是对伊斯兰教的亵渎。不食动物的血液也是一种古老的禁忌，后来被伊斯兰教沿用，定为教律。屠宰了牛、羊、鸡等家畜和家禽，收拾内脏时，讲究必须先把心割开，然后再收拾其他内脏，否则宰牲的人是有罪的。与此同时，他们也不食非教徒宰的牛、羊肉。即使是教徒也不能随意去宰杀。他们不允许坐在装有食物的箱子上。东乡族和保安族还禁止饮酒。
