陈云体质不好，妻子于若未曾用八个字来形容：“先天不足，后天失调。”他很容易感冒，常常一场感冒刚好一点，又得了新的感冒。他自己也说，他是一辆“木炭汽车”，开着开着就要出毛病，他为预防感冒，衣服总是比别人多穿一些。
陈云幼年失去双亲，由外婆抚养，生活艰辛。新中国成立后，担子重、工作忙，经常是上午下午连着开会、看文件、处理问题，晚上8点钟到周恩来那里，12点钟到毛泽东那里。但是，陈云都能有条不紊，从容应对。
1959年，他患了冠心病，后来经过治疗，有所恢复，但冠心病患者的帽子没有摘掉。1979年，他又患直肠癌，成功地做了手术切除。1984年，又发现他患有帕金森氏病。陈云以并不强壮甚至是赢弱的身体，顽强而又出色地工作，支撑着中国的经济大厦，直到晚年依然为中国的经济发展作贡献，他能享90岁高寿，真是不容易。
上世纪五六十年代，中国经济比较困难时，陈云一日三餐的伙食标准是：早餐稀饭、面包、牛奶、奶油、果酱、咸菜；午餐两个素菜、一个荤菜、二两米饭；晚餐为一个豆制品（即豆腐、豆腐干等）和一个素菜、一两半米饭。
早些年，大家担心伙食太差，影响他的健康，便提出晚饭时给他增加一小盘质量较好的营养菜，陈云却不答应。直到1962年，他的肠胃出了毛病，才和家人分开吃饭，也不过是加一些容易消化的食物。
陈云吃饭总是细嚼慢咽，不急不忙。主食大米饭，每次都要称重，中饭100克、晚饭75克大米。他每餐吃一小碟花生米，永远是13粒。每餐的米饭都吃完，一粒饭也不剩，饭粒掉到桌上要捡起来吃掉。他每餐配有水果，经常是香蕉。
他的这些食谱，是常年不变的，即使逢年过节和过生日，也不改变。本身是保健医生的于若木说：“正是他这种平衡的膳食，对他晚年的健康起了决定性的作用。他从不吃零食，也从不喝饮料，这保证了他的肠胃正常，从无积食或腹泻的情况发生。”他从来不请人吃饭，也不接受别人的宴请，总是自己吃自己的饭。
1952年，他戒掉了在革命战争年代养成的抽香烟的习惯，而且说戒就戒，一点也不含糊。戒烟后，他的体重增加了，不像以前那样怕冷，身体也比过去好。他晚年时曾说，他能长寿，得益于戒烟。
三年困难时期，中央机关好多人得了浮肿病。有心的于若木便去请教营养学家，专家说，病因是缺少蛋白质，其实每天吃二两黄豆就能解决问题。陈云知道后，马上起草电报要东北调黄豆进关，支援中央和北京。于若木风趣地说，那时有人管处级以上的干部叫“糖豆干部”，糖是指干部每月会发给一些白糖，豆就是指的黄豆。
