吃南瓜的好处很多，《本草纲目》认为，南瓜有补中益气、润肺化痰、消炎止痛、解毒杀虫等作用，人们常用南瓜辅助治疗哮喘、肿痛、烧烫伤等。近年来，科学家研究发现，每百克南瓜中含蛋白质0.5克、碳水化合物6.9克、胡萝卜素1. 06毫克。南瓜中的钴和锌可辅助治疗肝炎、肝硬化、肾炎、高血脂、糖尿病等病症。一个人如果小时候缺锌，生长就会迟缓，发育不良，个头长不高，甚至严重贫血；锌能刺激胸腺增肥，促使胸腺激素分泌，使T细胞增加，提高抗癌能力。缺钻会影响红细胞的生长，因为它是血液中红细胞组成的成分之一。人缺铁也能造成贫血。
常吃南瓜能补充上述缺陷。南瓜中所含果胶能黏结人体中多余的胆固醇，还能黏合人体中的细菌毒素、亚硝酸盐、放射性元素，它对农药也有一定的吸附和中和作用，从而清洁人体，提高肌体对有害物质的抗受能力，从而保护肠胃，减少发生结肠癌的危险，降低胆固醇。
南瓜的根、茎、叶、花、籽都可以疗疾，可以说全身都是宝。如南瓜子是食物中含磷最多的，每百克含磷达0. 67克。南瓜子炒熟研末，用蜂蜜调服，一日2次，每次30克，可治绦虫、姜片虫、蛔虫、急性血吸虫病；如果炒熟用水冲服，每次30克，则可治糖尿病，产后手脚浮肿。鲜南瓜子捣烂也可治烫伤。老年人多吃南瓜好处无穷。
多食用南瓜对身体没有什么坏处，一般人群均可食用。尤适宜肥胖者、糖尿病患者和中老年人食用。但南瓜性温，胃热炽盛者、气滞中满者、湿热气滞者少吃；同时患有脚气、黄疸、气滞湿阻病者忌食。
